Les eaux de surface continentales sont des plans d’eau douce ou saumâtre superficielle non côtiers ouverts (notamment fleuves, rivières, ruisseaux, lacs, étangs, sources). Leur zone littorale est comprise. Cette catégorie comprend les plans d’eau artificiels d’eau douce, saumâtre ou salée (canaux, bassins…) hébergeant une communauté semi-naturelle de plantes et d’animaux. Elle comprend également les plans d’eau saisonniers asséchés pendant une partie de l’année (rivières et lacs temporaires ou intermittents et leurs zones littorales). Les zones littorales d’eau douce comprennent les parties des rives ou des berges inondées assez fréquemment pour empêcher la formation d’une végétation terrestre fermée. Les neiges et les glaces pérennes sont exclues. Il convient de noter que les habitats associant étroitement des tourbières gorgées d’eau et des radeaux végétaux à des mares ouvertes sont considérés comme des complexes d’habitats.